Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kcnip3Q9QXT8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kcnip3Q9QXT8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms