Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trp53inp1Q9QXE4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms