Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Homer2Q9QWW1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Homer2Q9QWW1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms