Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rai2Q9QVY8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rai2Q9QVY8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms