Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkl2Q9QUK0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl2Q9QUK0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms