Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2bQ9JME9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vstm2bQ9JME9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms