Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul3Q9JLV5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul3Q9JLV5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms