Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpc4apQ9JLV2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc4apQ9JLV2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms