Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfrsf19Q9JLL3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf19Q9JLL3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms