Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aldh9a1Q9JLJ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh9a1Q9JLJ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms