Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pkd2l2Q9JLG4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms