Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tlr5Q9JLF7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlr5Q9JLF7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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