Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prg3Q9JL95 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prg3Q9JL95 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms