Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Upk3aQ9JKX8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms