Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ldb3Q9JKS4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms