Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrac1Q9JKP8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms