Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem1Q9JKE2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem1Q9JKE2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms