Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trem3Q9JKE1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms