Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ap3m1Q9JKC8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms