Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnga3Q9JJZ8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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