Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tuba8Q9JJZ2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms