Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Alyref2Q9JJW6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Alyref2Q9JJW6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Alyref2Q9JJW6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Alyref2Q9JJW6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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