Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gfra4Q9JJT2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gfra4Q9JJT2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms