Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nrip3Q9JJR9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms