Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riox1Q9JJF3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms