Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssna1Q9JJ94 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms