Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ28

Flii, Protein flightless-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FliiQ9JJ28 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FliiQ9JJ28 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FliiQ9JJ28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms