Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna1fQ9JIS7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1fQ9JIS7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms