Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Yipf7Q9JIM5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf7Q9JIM5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms