Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cxcl11Q9JHH5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cxcl11Q9JHH5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
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