Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tm9sf3Q9ET30 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tm9sf3Q9ET30 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tm9sf3Q9ET30 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms