Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rb1cc1Q9ESK9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rb1cc1Q9ESK9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms