Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ropn1Q9ESG2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ropn1Q9ESG2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ropn1Q9ESG2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ropn1Q9ESG2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ropn1Q9ESG2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ropn1Q9ESG2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ropn1Q9ESG2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ropn1Q9ESG2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ropn1Q9ESG2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ropn1Q9ESG2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms