Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trim54Q9ERP3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim54Q9ERP3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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