Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cse1lQ9ERK4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cse1lQ9ERK4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms