Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Clstn2Q9ER65 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms