Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr6Q9EQ16 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms