Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r50Q9EP51 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r50Q9EP51 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r50Q9EP51 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r50Q9EP51 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r50Q9EP51 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r50Q9EP51 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r50Q9EP51 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r50Q9EP51 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms