Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnft1Q9DCN7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms