Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ndufa8Q9DCJ5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndufa8Q9DCJ5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms