Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Eif3fQ9DCH4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Eif3fQ9DCH4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms