Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Syde1Q9DBZ9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Syde1Q9DBZ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms