Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cbx6Q9DBY5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms