Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018B08RikQ9DA83 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018B08RikQ9DA83 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018B08RikQ9DA83 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018B08RikQ9DA83 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700018B08RikQ9DA83 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700018B08RikQ9DA83 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700018B08RikQ9DA83 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700018B08RikQ9DA83 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700018B08RikQ9DA83 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700018B08RikQ9DA83 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700018B08RikQ9DA83 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms