Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmbim4Q9DA39 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmbim4Q9DA39 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmbim4Q9DA39 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmbim4Q9DA39 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms