Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms