Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D8N1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D8N1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms