Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
U2af1Q9D883 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2af1Q9D883 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms