Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slx4ipQ9D7Y9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4ipQ9D7Y9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms