Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl40Q9D783 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl40Q9D783 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms